本次的全新作品是纪念TV版动画播放20周年特别篇。剧中，听从黑衣组织命令研发出Apoptoxin4869的灰原哀等人将重新登场，而尚未和柯南相遇的少年侦探团、阿笠博士以及柯南尚未寄居到小兰家时的毛利小五郎也将会悉数亮相。
该剧讲述了有三重人格的女律师方以因被迫收知晓她秘密的利东佳为徒，让他帮助自己保守秘密，从而引发一连串搞笑故事。
故事讲述了行进在近海上的豪华游艇上连续发生的几起杀人事件，凶手神出鬼没，游艇上的警察都素手无策，能否活着靠岸成为了身处险境中的人们最大的愿望。“苏大侦探”柳飞云开始介入对事件的调查，但是还是接连有人被
